‧沿革
本分局於民國81年9月設立，設立初期與臺南市稅務局於本市中西區忠義路一段96號合署辦公，84年因業務擴增，乃與南區國稅局總局一同遷移至臺南市北區富北街7號現址(國稅大樓1、3至5樓)，並於100年1月1日因應臺南縣市合併改制更名為「財政部臺灣省南區國稅局臺南分局」，於102年1月1日配合政府組織改造，再次更名為「財政部南區國稅局臺南分局」。
‧服務轄區
本分局服務轄區為臺南市東、南、中西、北及安平區。
‧組織架構
‧臺南分局組織圖說明：
設分局長、秘書、稽核、政風室、主計室 、人事室 、營所遺贈稅課、綜所稅課、銷售稅一課、銷售稅二課、服務管理課
營所遺贈稅課：營利事業所得稅、遺產及贈與稅
綜所稅課：綜合所得稅、執行業務、其他所得、扣繳憑單申報、證券交易稅、期貨交易稅
銷售稅一課：營業稅
銷售稅二課：營業稅查核、貨物稅、菸酒稅、特種貨物及勞務稅
服務管理課：為民服務、租稅教育、租稅宣導、欠稅管理、行政業務
主計室：歲計、會計、統計
人事室：任免遷調、詮審動態、考核獎勵、待遇福利、退休撫卹
政風室：政風法令宣導、貪瀆不法預防、政風興革建議、公務機密維護
‧轄區基本徵課資料(工商家數及各項申報統計)
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南區國稅局臺南分局轄區人口數、工商家數、各項申報統計 |
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轄區人口數：572,234；轄區面積：69.1422平方公里 |
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工商 |
使用發票戶28,105家 |
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各項 |
‧110年度扣(免)繳憑單及股利憑單申報收件家數及件數合計37,067家、1,391,188件：含人工申報3,722家、13,765件；媒體申報101家、549,081件；網路申報33,244家、828,342件。(截至111.5.31) ‧109年度綜合所得稅結算申報收件件數合計168,672件：含人工申報3,529件；二維申報257件；網路申報108,993件；稅額試算55,893件。(截至111.5.31) ‧109年度營利事業所得稅結算申報收件件數合計23,833件：網路申報23,782件；人工申報51件。(截至111.5.31) |